Im ehemaligen Inspektorhaus des Botanischen Gartens befindet sich eine "Goethe-Gedenkstätte". 1921 wurde hier ein Goethemuseum eingerichtet. Die schlichte Hofanlage aus verputzten Fachwerkgebäuden ist im äußeren Erscheinungsbild weitgehend erhalten. Zwei Memorialräume im Erdgeschoss vermitteln Eindrücke von der Wohn- und Arbeitswelt zur Zeit Goethes und gestatten einen Einblick in sein naturwissenschaftliches und dichterisches Schaffen während seiner Jena-Aufenthalte. In Vorbereitung ist eine neue Dauerausstellung der Universität zu Goethes Morphologie und Metamorphosenlehre.

Bei der Goethe-Gedenkstätte handelt sich nicht um eine genuin wissenschaftliche Sammlung.

Das Inspektorenhaus und die darin befindliche Goethe-Gedenkstätte wird vom Schillerhaus der Universität Jena verwaltet.