Das Institut für Geologische Wissenschaften der FU Berlin besitzt eine paläontologische Lehr- und Übungssammlung, von der Übungsmaterial auch zur Ausleihe an Schulen zur Verfügung steht. Das Material ist größtenteils in Schränken verschlossen, nur einige wenige schöne Schauexemplare sind in Vitrinen ausgestellt.

Die Sammlung erfasst verschiedene systematische Bereiche.
Hier hervorzuheben ist die Mikropaläontologische Sammlung, die mehrere tausend Stücke von Mikrofossilien beinhaltet. Daneben existiert eine systematisch gegliederte Invertebratensammlung, eine paläobotanische Sammlung mit dem Schwerpunkt Permokarbon und Quedlinburger Oberkreide, eine stratigraphische Sammlung, die ursprünglich zur Geologie gehörte, aber heute von der Paläontologie betreut wird und einigen weiteren Spezialsammlungen.
Dazu gehört auch die Charophyten-Sammlung von Michael Schudack. Diese Sammlung ist die bisher umfangreichste Kollektion fossiler Charophyten (Armleuchteralgen) in Deutschland. Darunter findet sich auch die Sammlung Mädler aus Hannover.

Neben der Charophyten-Sammlung existiert eine Spezialsammlung pathologischer Ammoniten von H. Keupp. Dieses 12.000 Exemplare umfassende Sammelsurium beinhaltet größtenteils Material aus der Zeit des Jura.

Letztendlich gibt es noch eine 20.000 Exemplare umfassende Guimarota- Sammlung, der berühmten Oberjura-Fundstelle in Portugal, die u.a. frühe Säugetiere präsentiert.