Als das Institut in den 1960er Jahren gegründet wurde, konnte diese Sammlung aus dem Institut für Botanik ausgegliedert werden. Es handelt sich bei den Einzelstücken überwiegend um Ganzdrogen. Diverse Schaustücke sind längst obsolet und kaum noch zu beschaffen. Gerade in alten Harzen und im Balsam spiegelt sich aber die alte Pharmakognosie wider. Die Sammlung dient überwiegend als Anschauungsmaterial, in sehr seltenen Fällen werden Proben für Vergleichsuntersuchungen unternommen.

2015 umfasste die Sammlung circa 400 Standgefäße einer alten Schausammlung von Gewürz- und Arzneidrogen. Nach 2015 wurde die Sammlung durch Schimmel- und Wasserschäden erheblich dezimiert, daher ist sie für die Lehre obsolet. Die Reste wurden magaziniert. Ein Neuaufbau der Sammlung ist aktuell nicht geplant.